設定をわけたい場合はconfigurationオプション

pluginディレクトリの追加を行った場合、Eclipse2では、workspaceに情報が保存されていたが、Eclipse3では、configurationディレクトリに情報が保存される。基本EclipseをＡの場合、Ｂの場合とわけて使いたい、場合、起動時に-configurationを指定する。

C:\eclipse3\eclipse -data C:\project\test\sd\workspace -configuration file://C:/project/test/configuration/

• configurationの指すのはconfig.iniを含むディレクトリのもよう。
• data(workspaceのディレクトリ)はいらないかな？指定しない場合は、起動時にワークスペースの場所をきかれる。

なお、起動オプションはEclipseのヘルプに書いてます。